聚丙烯酰胺凝膠垂直板電泳是以聚丙烯酰胺凝膠做支持物的一種區(qū)帶電泳，由于此種凝膠具有分子篩的性質(zhì)，所以本法對樣品的分離作用，不僅決定于樣品中各組分所帶凈電荷的多少，也與分子的大小有關。其次，聚丙烯酰胺凝膠電泳還有一種獨特的濃縮效應，即在電泳開始階段，由于不連續(xù)pH 梯度的作用，將樣品壓縮成一條狹窄區(qū)帶，從而提高了分離效果。 聚丙烯酰胺凝膠具有網(wǎng)狀立體結構，很少帶有離子的側(cè)基，惰性好，電泳時，電滲作用小，幾乎無吸附作用，對熱穩(wěn)定，呈透明狀，易于觀察結果。 聚丙烯酰胺凝膠是由單體丙烯酰胺(簡稱Acr)和交聯(lián)劑聚丙烯酰胺凝膠簡稱Bis)在催化劑的作用下，聚合交聯(lián)而成的含有酰胺基側(cè)鏈的脂肪族大分子化合物。